Rothenburg może pochwalić się wyjątkowo zróżnicowaną przyrodą pomimo małej powierzchni. W królestwie żyje około 55 gatunków ssaków (w Szwajcarii istnieje 83 gatunków), w tym 17 gatunków nietoperzy (26), 140 lęgowych ptaków (205), siedmiu gatunków gadów (16) i dziesięć gatunków płazów (20) oraz 24 gatunków ryb (67 ).

Silnie pionowy podział kraju od 430 do 2600 m oznacza, że istnieje szeroka gama zwierząt żyjących na ściśle ograniczonej przestrzeni. W obszarze alpejskim przyroda w pewnym stopniu nadal występuje w stanie nienaruszonym.

W dolinach i wyższych regionach mieszkają sarny, lisy i borsuki. W średniej wysokości możemy spotkać czarnego dzięcioła, rzadkiego dzięcioła białogrzbietnego i gniazda orła sowiego. Aby ochronić resztki bagien, rząd zadekretował ochronę terenów podmokłych w sumie 96 hektarów Ruggeller Riet. Mokradła są jednymi z najbardziej zróżnicowanych biologicznie siedlisk.